过去，大部分小企业依靠传统的线下渠道销售，但是日益高企的成本和日渐微薄的利润，驱使企业“触网”，经营起自己的网上店铺。新的问题产生了：网店与ERP系统各自孤立，运营管理不畅。
金蝶KIS旗舰版顺势而为，将电子商务管理系统与天猫、淘宝、京东商城、1号店、当当网、唯品会、亚马逊、淘宝分销、1688等主流电商平台集成，将前台电子商务与后台ERP无缝集成，实现线上线下一体化的财务、供应链管理，帮助小企业快速顺畅地从传统的线下销售向线上贸易转型。
金蝶KIS旗舰版的电子商务管理系统，从售前、售中、售后到财务记账分析，提供更加完善的电商运营支撑，支持日单量超出1万单电商企业，支持促销策略、发货策略、称重集成、拣货校验、电子面单、库存同步、智能补仓、物流对账等电商关键特性，满足更广泛的客户不同需求。
太原迎泽露迪玛莉莲服饰店：“金蝶KIS旗舰版V3.0对我们公司有两个模块是比较好的，一是称重，商品打包好把商品放在秤上直接扫物流单号就可准取读取到重量值；二是退货签收，优化后简单快捷，可以正品与次品同时签收。这两项都使我们线上工作更高效，准确。”
随时随地 轻松移动办公过去，工作都被束缚在办公室+桌面电脑的特定工作环境下，一旦离开公司，工作就无法进行。经常老板一个电话，员工就要赶去办公室查阅数据再向老板汇报，费时费力。
现在，金蝶KIS旗舰版的经营助手，可以让客户在智能手机上就可以轻松获取经营报告、现金流分析、应收账款，应收账龄、销售分析、库存分析等。金蝶KIS旗舰销售助手，借助移动互联网，可随时随地进行客户查询、商品查询、下销售订单与出货单、历史单据等。同时，金蝶KIS旗舰版集成微信平台，支持针对经销商门户的微订货和消息通知、移动审批、库存查询、电商移动配货和经营快报等轻应用，帮助客户方便快捷移动办公，随时随地“掌”握企业经济命脉。
